自建房超层了的自建处理是房屋的所有人无法办理相应的产权证及土地使用权证，再就是房超要缴纳相关的费用，如果是该处构成违建的，则会被要求限期拆除。自建如果是房超没有违法但被强拆的，则是该处可以起诉处理。
一、自建自建房超层了应该怎么处理
1.无法获得超审批面积部分的房超产权证及土地使用权证。
2.房主主动向审批机关报告，该处补交一定的自建费用，如临时建筑费等，房超应该不会被罚款。该处如果是自建隐瞒了超建的情况并被相关部门查实，就有可能被视为违章建筑，房超被要求限期拆除。该处
二、自建房超层被强拆该如何办理
除由法院裁定的强制拆除外，其它任何形式强制拆除房屋都是非法的，面对非法强拆，建议当事人三步走来维护自己的合法权益：
1.及时报警，敦促警察对非法强拆立案调查。
2.摄影摄像，固定现场证据。
3.及时委托律师介入，调查取证，提起诉讼。
三、自建房超层被强拆涉及哪些法律责任
律师在线提醒您，强拆行为涉及如下法律责任：
刑事责任、民事责任、行政责任。如违法强拆造成人员伤亡的，可能构成故意伤害罪。如造成人员受伤，财产受损，在不构成犯罪的情形下，应承担民事侵权责任。除此之外，违法强拆行为会受到治安管理处罚。
《国有土地上房屋征收与补偿条例》第三十一条
采取暴力、威胁或者违反规定中断供水、供热、供气、供电和道路通行等非法方式迫使被征收人搬迁，造成损失的，依法承担赔偿责任；对直接负责的主管人员和其他直接责任人员，构成犯罪的，依法追究刑事责任；尚不构成犯罪的，依法给予处分；构成违反治安管理行为的，依法给予治安管理处罚。
